Η Άννα Καραβαγγέλη έχει σπουδάσει Βιολογία στο Πανεπιστήμιο Κρήτης, και είναι κάτοχος μεταπτυχιακού τίτλου σπουδών στην Πληροφορική στην Ιατρική και τη Βιολογία από το Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών. Έχει ευρεία εμπειρία στη βιοπληροφορική, συμπεριλαμβανομένης της ανάλυσης δεδομένων αλληλούχισης επόμενης γενιάς (NGS), των στατιστικών και υπολογιστικών μεθόδων, των εφαρμογών μηχανικής μάθησης και της διαχείρισης βιολογικών βάσεων δεδομένων. Ερευνητικά έχει ασχοληθεί με το ρόλο των μη κωδικών μεταγραφών στη γονιδιακή ρύθμιση και τον μετα-μεταγραφικό έλεγχο και έχει συμβάλει σε αυτόν τον τομέα μέσω δημοσιεύσεων σε έγκριτα διεθνή επιστημονικά περιοδικά.